提高动物饲料效率可以增加维持营养代谢能、生产性能和经济效益。在养殖行业常用动物的饲料转化率评估饲料效率，然而在生产实际中不同体型和生长速度的动物之间饲料效率存在差异，无法用料重比来衡量。因此，在1963年Koch等^[1]采用了一种在恒定增重和中等体重条件下的饲料消耗量或具有相同的预期增重和维持能量需求的饲料消耗量来评估饲料效率。目前，剩余采食量(residual feed intake，RFI)被广泛用于评价饲料效率，它是生产中实际采食量和根据动物生产(即生长、产奶、仔畜生产等)和体况维持的预期采食量之间的差值来计算，低RFI的动物消耗饲粮更少，效率更高；而高RFI的动物效率则更低。家畜的饲料成本在畜牧业生产成本中占总成本的60%~70%，提高饲料效率对动物养殖经济效益变得尤为重要^[2]。在生产实践中选育低RFI动物不仅可以降低生产成本，还可以减少因甲烷及粪便排放引起的环境污染，特别是在饲料成本上升或家畜价值下降的时期，选择更高效的种畜可以极大地保持经济效益。

反刍动物瘤胃中含有大量的微生物，对饲料消化起到了至关重要的作用，与瘤胃微生物相关的一些生物途径可以显著影响宿主的能量代谢和生长性能，反过来宿主为微生物繁殖提供了一个富含底物的环境。挥发性脂肪酸(volatile fatty acid，VFA)是瘤胃发酵产生的主要产物，也是反刍动物能量利用的主要能源物质，占总能需求的80%^[3]。瘤胃上皮吸收和代谢短链脂肪酸能力的差异可能与饲料效率的差异有关，因此通过研究不同RFI反刍动物在瘤胃功能上的生物学基础，发现差异微生物或差异表达基因对养殖生产有重大的指导意义。目前，RFI在反刍动物的研究主要集中在影响RFI的生理学基础、RFI遗传与变异和甲烷的排放^[4]。本文综述了近年来RFI与瘤胃上的功能差异和分子生物学研究，从瘤胃功能上为反刍动物提高饲料效率和分子选育提供理论基础。

1 RFI计算模型

RFI的计算模型是通过维持能量(代谢体重)与生产性能(日增重、产奶量)来预测采食量的一种线性模型。根据RFI模型，验证其模型方程的截距是否显著，若截距显著，则可根据该模型计算预期采食量。目前主要有4种RFI预测模型。

第1种最初是由Koch等^[1]提出：

$ {Y_i} = {\beta _0} + {\beta _1}{\rm{AD}}{{\rm{G}}_{\rm{i}}} + {\beta _2}{\rm{MW}}{{\rm{T}}_{\rm{i}}} = {e_i}。$

式中：Y_i为动物i的干物质预期采食量；β₀为模型回归截距；β₁为平均日增重(ADG)的干物质采食量(DMI)偏回归系数; β₂为中期体重(MWT)对DMI的偏回归系数；e_i为动物i对DMI中的随机误差，下同。

第2种是澳大利亚肉牛饲料效率估计模型：

$ {Y_i} = {\beta _0} + {\beta _1}{\rm{AD}}{{\rm{G}}_{\rm{i}}} + {\beta _2}{\rm{MMW}}{{\rm{T}}_{\rm{i}}} = {e_i}^{\left[ 5 \right]}。$

式中：MMWT_i为平均中期代谢体重。

第3种是法国绵羊预测模型，增加了体况预测因子：

$ {Y_i} = {\beta _0} + {\beta _1}{\rm{AD}}{{\rm{G}}_{\rm{i}}} + {\beta _2}{{\rm{W}}_{{\rm{mid - test, i}}}} + {\beta _3}{\rm{FD}} + {\beta _4}{\rm{MD}} + {e_i}^{[6]}。$

式中：W_mid-test为中期体重；FD为背部脂肪厚度；MD为第12到13肋骨间肌肉深度。

第4种是澳大利亚饲养标准预测模型，该模型包括维持所需的净能(NER_m)和中期体重所需的净能(NER_g)^[7]：

$ {\rm{NE}}{{\rm{R}}_{\rm{g}}} = \{ {\rm{EBG}} \times [(20.3 - R)/1 + {\rm{exp}}(2.4 - 6P)] + (6.7 + R)\} /{K_g}。$

式中：EBG为空腹体重(EBG=0.92×ADG)；R为体重的增减量[R=250×EBG/(SRW^0.75)-1，SRW为标准体重=77]；P为生长阶段(P=ALW/SRW，AWL为中期平均体重)；K_g为代谢能效率(K_g=0.042×M/D+0.006，M/D为干物质饲料能量密度，下同)。

$ {\rm{NE}}{{\rm{R}}_{\rm{m}}} = K \times 0.28 \times {\rm{ALW}}0.75 \times {\rm{exp}}\left( { - 0.03{\rm{A}}} \right)/Km + 0.1 \times {\rm{NE}}{{\rm{R}}_{\rm{g}}})。$

式中：K=1(山羊或绵羊)；A为年龄；Km为维持代谢能效率(Km=0.5+0.02M/D)。

所需的总能=NER_m+NER_g，然后根据能量含量换算成干物质采食量即RFI预测值。然而一些影响RFI差异的因素没有被考虑进去，如遗传、环境和测量误差。同样一些动物生物学过程也可造成RFI表型的差异，如饲料消化、甲烷的排放、饲喂过程、热增耗、代谢过程、奶牛泌乳阶段、运动和动物体况等^[8]。Olijhoek等^[9]通过动物运动和甲烷产量作为能量消耗建立新的剩余采食量表型模型，结果发现该模型对RFI差异影响很小。Li等^[10]发现忽视泌乳阶段造成奶牛RFI的错误评估。因此在模型建立之初，应考虑上述能量损耗是否影响RFI或者能量损耗较低对生产可以忽略不计。此外，应在相同的遗传水平动物和试验环境条件下，尽可能地减小由试验所带来的误差。

2 不同RFI动物与瘤胃功能之间的差异 2.1 RFI与瘤胃发酵参数的关系

瘤胃pH是瘤胃功能的重要参数，与饲粮种类和饲料效率有直接关系^[11]。瘤胃内微生物最适pH为6.46~6.80，偏低或偏高都会影响瘤胃微生物的丰富度和活性^[12]。Liang等^[13]根据瘤胃微生物丰度和发酵参数的研究表明，低RFI个体瘤胃pH更低，并且低RFI个体瘤胃环境比高RFI个体更稳定。然而也有研究发现RFI差异对瘤胃pH影响不明显^[14-15]。

VFA是宿主微生物发酵和瘤胃上皮吸收的重要参数，是衡量动物的饲料效率重要指标。VFA对动物体代谢最为重要的有直链乙酸、丙酸和丁酸，乙酸、丙酸、丁酸占瘤胃发酵VFA总产量的70%~75%^[16]。Guan等^[17]研究发现，低RFI奶牛瘤胃内总VFA含量有增加的趋势，其中丁酸盐和戊酸盐含量显著升高，丁酸盐能在瘤胃壁上转化为酮体和β-羟丁酸，它们是许多组织非常重要的能源物质，因此在低RFI条件下奶牛饲料效率更高。Hernandez等^[18]发现异戊酸盐在高RFI牛中的比例显著高于低RFI牛，直链VFA与支链VFA比例显著降低。Mcdonnell等^[19]对比了3种饲粮对饲料效率差异的影响，发现只提供青贮饲料时，低RFI牛瘤胃乙酸与丙酸比例更高，但放牧和精粗比为3 ∶ 7的全混合日粮条件下不存在差异。能量代谢在不同RFI肉牛中存在显著差异，微生物发酵产生的底物直接参与了宿主的能量代谢，这可能与RFI的差异有关^[20]。综上所述，低RFI动物瘤胃pH较低，瘤胃环境更稳定，含有较高含量的丁酸、乙酸和丙酸，但饲料差异也是影响低RFI动物瘤胃发酵参数的因素之一。

2.2 RFI与甲烷的排放

反刍动物中87%的甲烷主要在瘤胃中产生，甲烷消耗能占摄入总能量的5%~10%^[21]，胃肠道产生的甲烷排放是反刍动物可消化能量损失的重要途径。据估计反刍动物生产的甲烷占温室气体总量的近6%^[22]，因此减少瘤胃甲烷的产生可提高反刍动物的饲料转化率并且可降低环境污染。反刍动物个体甲烷产量差异与瘤胃微生物甲烷菌有关，Ellison等^[23]发现采用青贮料饲喂羔羊时，史氏甲烷短杆菌(Methanobrevibactr smithii)在低RFI羊瘤胃中丰度更高，但可以降解甲烷的菌种，如Mitsuokella jalaludini丰度并没有发现与RFI有显著差异。而Zhou等^[24]发现不管在高精料或高粗料饲喂时，史氏甲烷短杆菌和瘤胃甲烷短杆菌(Mitsuokella. ruminantium)在高RFI牛瘤胃中丰度更高，这似乎更符合理论事实。Hegarty等^[25]在安格斯肉牛研究中以大麦为基础饲粮，采用育种值(EBV)估计RFI模型，来量化RFI与日产甲烷率(MPR)之间的关系，发现低RFI牛MPR较低，相比同代牛中高RFI牛甲烷产生量减少了25%，并且甲烷效率也较低。Muro-Reyes等^[26]利用总能量摄入和干物质摄入估算甲烷排放，低RFI山羊甲烷排放量比高RFI少19%，表明低RFI山羊在不影响生产参数的情况下减少了甲烷排放。在奶牛的研究中也报道同样的结果，RFI较低的动物，其DMI往往较低，饲料转化率也较高，甲烷排放量也较低^[27]。这说明在低RFI的反刍动物中甲烷产生量更少，甲烷效率低，使得低RFI的牛能量损耗更低。但Flay等^[28]在以苜蓿为基础饲粮的研究中，发现RFI差异不会影响MPR，低RFI奶牛甲烷效率(MY)更高，造成这种结果可能是苜蓿影响了奶牛瘤胃甲烷菌的活性，进而使MY增加。Mcdonnell等^[19]研究发现，DMI、代谢体重(BW^0.75)、MPR和相对于代谢体重甲烷产量在低RFI牛和高RFI牛之间没有差异，在低RFI牛中较高，说明MY与DMI差异有关。Olijhoek等^[5]研究了不同奶牛品种在精粗比不同的条件下甲烷产量与RFI之间的关系，发现高精料饲粮娟姗牛甲烷排放显著降低，将RFI作为连续变量时，随着RFI降低，MY反而会增加，这与Flay等^[28]和Mcdonnell等^[19]研究结果相似。Herd等^[29]提出了剩余甲烷排放，通过实际排放与预测排放之差来计算，发现剩余甲烷排放与MY强相关，与DMI无关，与生产性状弱相关。综上所述，产甲烷菌的数量与甲烷排放有直接关系，筛选影响不同RFI个体产甲烷菌的代谢途径或差异基因将有利于控制甲烷排放；由于RFI差异对MY的影响不确定，因而采用剩余甲烷排放可作为未来FRI对甲烷排放研究的另一种方式；饲粮差异、环境和遗传变异都会影响甲烷排放，因此在未来的RFI的研究中甲烷排放需要进行重新评估。

2.3 瘤胃中微生物与RFI之间的关系

瘤胃微生物对饲料的发酵为反刍动物提供70%的能量来源，微生物的组成与变化直接与生产效率相关^[30]。Guan等^[17]采用PCR变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术研究了不同RFI的安格斯肉牛在饲喂高精粮饲粮时瘤胃内菌谱的组成，发现不同RFI的奶牛瘤胃菌谱明显不同，低RFI奶牛瘤胃内菌谱成分的相似性(91%)显著高于高RFI奶牛瘤胃内菌谱成分的相似性(71%)，表明某些特异性菌可能存在于低RFI中，而在高RFI中则不存在，并且研究发现在同一品种内瘤胃菌谱分布存在明显差异，说明宿主遗传可能在瘤胃微生物结构中起重要作用。Mccann等^[31]应用PCR-DDGE条带模式发现，不同RFI公牛的瘤胃中的普雷沃氏菌的种类在生长期饲粮饲喂与放牧牧草2种条件下存在显著差异，结果表明饲粮差异会影响普雷沃氏菌，进而可能会影响饲料效率，因为普雷沃氏菌种类繁多，是瘤胃中的优势细菌，能产生琥珀酸，它能利用各种碳水化合物及分解和利用纤维素、半纤维素、果胶、淀粉、糖和蛋白质。RFI与奶牛瘤胃菌群差异的研究发现，瘤胃微生物菌群丰度可能与饲料效率相关，对检测到的瘤胃核心微生物操作分类单元(OTUs)与RFI做关联性分析时发现，与高RFI相关的核心OTUs为普雷沃氏菌和丁酸菌，而低RFI相关的核心OTUs也是普雷沃氏菌，高RFI奶牛的总瘤胃菌群落有较高丰度的厌氧弧菌和丁酸弧菌，低RFI奶牛则拥有较高丰度的粪球菌，然而单个菌群的差异还很难解释不同RFI个体间的差异^[32]。Henderson等^[33]发现无论哪种反刍动物，瘤胃微生物菌群都是由核心微生物群落主导的，饲粮对瘤胃微生物菌群的影响大于物种。Ellison等^[18]研究了羔羊饲粮和饲料效率与瘤胃微生物的关系，结果证实了饲粮是影响瘤胃微生物组成的主要因素。此外，还证明关键微生物种类可能在调节饲料效率中发挥重要作用，而这些微生物种类可能因饲粮成分的不同而有所不同。马万浩等^[34]对湖羊育肥期精粗比为75 ∶ 25饲粮条件下不同FRI影响生长性能和消化道微生物多样性进行了研究，结果显示高RFI组理研菌科_RC9_gut_group属相对丰度显著高于低RFI组，对其他瘤胃内几乎所有菌属相对丰度均无显著影响，因此，认为不同RFI对湖羊瘤胃的影响只体现在个别可能具有重要作用的菌属上。出现这种结果也可能是在高精料饲喂情况下，瘤胃pH降低，瘤胃微生物的多样性和活性降低，微生物趋于一致，造成不同RFI羔羊瘤胃菌属差异不明显。综上所述，大多数研究中不同RFI个体瘤胃微生物群落差异可能是由于动物品种和饲粮差异造成的，虽然影响RFI差异相关的微生物所知较少，但存在显著差异。

宏基因组学和转录组学是在基因水平上研究微生物菌群功能，可以解释分子水平与性状之间的关系。Li等^[30]通过转录组水平研究了肉牛瘤胃微生物活性与RFI之间的联系，试验基于16S rRNAs瘤胃微生物活性及代谢功能，通过对比分析发现，3种细菌科(松科、乳杆菌科和韦氏菌科)在高RFI动物中丰度较高，一种古细菌分支(甲烷瓣菌纲)在低RFI牛中丰度较高，2组间有32条微生物代谢途径和12个碳水化合物活性酶(CAZymes)表达差异显著，其中，30种代谢途径和11种CAZymes在高RFI瘤胃中高表达，2种代谢途径和1种CAZyme在低RFI瘤胃中高表达，因此认为高RFI牛瘤胃微生物菌群活性比低RFI牛的瘤胃微生物菌群活性更高，这可能与宿主饲料效率的变化有关。Rocky等^[35]通过宏基因组测序技术研究不同RFI动物微生物之间的代谢关系，在低RFI和高RFI动物中没有发现任何酶的活性存在显著差异，但从代谢途径中发现低RFI动物的微生物酶比高RFI动物更容易参加宿主代谢反应，并且低RFI动物拥有更短的碳链参与代谢反应。反刍动物瘤胃中微生物种类繁多且复杂，并且瘤胃代谢是一个动态过程，微生物活性在代谢过程中存在差异，因此关键微生物代谢可能影响饲料效率。

2.4 瘤胃上皮细胞基因表达与RFI相关性研究

转录组研究可以在不同的环境和个体条件下研究基因功能和机体的分子机理。瘤胃上皮是一个代谢非常活跃的组织，为细胞增殖、运输、收缩和保护提供能量，瘤胃发酵产生的短链脂肪酸主要通过简单扩散和特异性蛋白介导的转运机制被瘤胃上皮吸收^[36]，瘤胃上皮细胞吸收和代谢短链脂肪酸很可能与RFI存在相关性。为此，Kong等^[37]基于转录组研究了不同RFI的赫里福德×安格斯牛瘤胃上皮细胞基因表达的差异，发现了122个差异表达基因，分析发现这些基因参与乙酰化、黏附连接的重塑、细胞骨架动力学、细胞迁移和细胞更新等生物学过程，通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)，鉴定出1个包含764个基因的显著基因模块，与RFI呈负相关。功能分析显示，通过黏附连接、蛋白质和细胞周转以及细胞骨架组织，参与调控细胞间黏附的基因显著富集。此外，低RFI牛瘤胃上皮细胞中线粒体、乙酰化和糖酵解、三羧酸循环、氧化磷酸化等能量生成途径相关基因的表达增加，可能是低RFI牛的瘤胃上皮细胞增加了组织形态发生，增加了营养物质吸收的细胞旁通透性，进而增加了能量生产以支持增加的组织形态发生的能量需求。Rathert等^[38]重复了Kong等^[37]的研究，测试了与上一个研究无亲缘关系的海福特×安格斯牛群，并选择了13个被Kong等^[37]鉴定为与RFI相关的候选基因进行了验证，结果发现着丝粒相关蛋白E基因表达与Kong等^[37]研究结果相同，从而认为这种饲料效率关系在品种和环境上存在一定的差异。有研究表明，在对瘤胃上皮组织能量代谢的研究中发现，低RFI牛瘤胃上皮中参与氧化磷酸化的基因，泛素-细胞色素c还原酶10(UQCR10)和泛素氧化还原酶B4亚基(NDUFB4)表达减少，他们推测效率更高的动物(低和中RFI)在该组织中具有较低的能量消耗^[39]。Elolimy等^[40]在牛瘤胃上皮细胞中发现34个差异表达基因，其中低RFI牛瘤胃上皮细胞中与VFA吸收、代谢、生酮和免疫/炎症反应方面相关的基因高表达，但在RFI与性别相互作用的研究中表明，RFI组间基因差异表达是由性别引起的，低RFI组公牛中溶质载体家族9成员A1(SLC9A1)、缺氧诱导因子1亚单位α(HIF1A)、乌头酸酶2抗体(ACO2)显著高表达，低RFI母牛3-羟基丁酸脱氢酶1(BDH1)基因高表达，而溶质载体家族9成员A2(SLC9A2)和丙酮酸脱氢酶E1亚基α1(PDHA1)基因低表达。尽管低RFI或高RFI条件下参与氧化磷酸化的基因表达存在争议，这可能与动物的品种和性别差异等外在因素有关，但可以确定的是瘤胃上皮细胞的能量代谢显著影响RFI差异。

3 小结

反刍动物瘤胃微生物、瘤胃发酵参数和瘤胃产甲烷菌以及瘤胃上皮细胞的基因表达差异均会影响饲料效率。目前RFI相关研究结果显示，关键瘤胃微生物差异与RFI差异有关，还需进一步测序发现是那些微生物主导了这种差异；低RFI动物瘤胃pH较低，瘤胃环境更稳定，更有利于短链脂肪酸代谢；瘤胃甲烷排放与RFI差异研究结果不尽一致，剩余甲烷排放可作为未来RFI与甲烷排放研究中的另一项补充方法；瘤胃上皮细胞的能量代谢对RFI差异影响显著，但关键基因和关键能量代谢途径还需进一步研究；同样，饲粮差异、动物品种和环境在影响饲料效率方面的作用也不应该被忽视。总之，通过瘤胃功能选育高饲料效率动物的方法是行之有效的。