1 材料与方法
1.1 试验设计和试验饲粮
表1 饥饿诱导换羽程序Table 1 Starvation induced moulting procedures |
| 分期 By stages | 处理阶段 Processing phase | 饲粮 Diet | 饮水 Drinking water | 光照 Light/(h/d) | |
|---|---|---|---|---|---|
| 预试期 Preliminary trial period | 适应期 | 第1~7天 | 自由采食 | 自由饮水 | 16 |
| 正试期 Probationary period | 禁食期 | 第8~10天 | 停料 | 停水 | 8 |
| 第11~22天 | 停料 | 自由饮水 | 8 | ||
| 恢复期 | 第23~24天 | 30 g/只 | 自由饮水 | 每天增加0.5 | |
| 第25~26天 | 60 g/只 | 自由饮水 | 每天增加0.5 | ||
| 第27~28天 | 90 g/只 | 自由饮水 | 每天增加0.5 | ||
| 第29~30天 | 120 g/只 | 自由饮水 | 每天增加0.5 | ||
| 第31~38天 | 自由采食 | 自由饮水 | 每天增加0.5,直至16 | ||
| 第39~54天 | 自由采食 | 自由饮水 | 16 | ||
表2 基础饲粮组成及营养水平(风干基础)Table 2 Composition and nutrient levels of the basal diet (air-dry basis) % |
| 项目Items | 含量Content |
|---|---|
| 原料Ingredients | |
| 玉米Corn | 65.00 |
| 豆粕Soybean meal | 23.00 |
| 石粉Limestone | 7.00 |
| 预混料Premix1) | 5.00 |
| 合计Total | 100.00 |
| 营养水平Nutrient levels2) | |
| 代谢能ME/(MJ/kg) | 10.87 |
| 粗蛋白质CP | 15.50 |
| 钙Ca | 3.50 |
| 总磷TP | 0.60 |
| 有效磷AP | 0.32 |
| 蛋氨酸Met | 0.32 |
| 赖氨酸Lys | 0.70 |
| 蛋氨酸+胱氨酸Met+Cys | 0.56 |
| 苏氨酸Thr | 0.50 |
1)预混料为每千克饲粮提供The premix provided the following per kg of the diet:VA 10 000 IU,VD3 2 000 IU,VE 90 IU,VK3 5 mg,VB1 3 mg,VB2 15 mg,VB6 5.5 mg,VB12 0.03 mg,D-生物素 D-biotin 0.3 mg,D-泛酸 D-pantothenic acid 16 mg,叶酸 folic acid 1 mg,烟酰胺niacinamide 55 mg,氯化胆碱 choline chloride 500 mg,Fe (as ferrous sulfate) 60 mg,Cu (as copper sulfate) 9 mg,Mn (as manganese sulfate) 100 mg,Zn (as zinc sulfate) 100 mg,Se (as sodium selenite) 0.3 mg。 | |
2)代谢能、有效磷和氨基酸为计算值,参考《中国饲料成分及营养价值表(2023年第34版)》进行计算,粗蛋白质、钙和总磷为实测值,测定方法分别依据GB/T 6432—2018、GB/T 6436—2018和GB/T 6437—2018。The calculated values of ME, AP and amino acids were calculated with reference to the Table of Feed Composition and Nutritional Value in China (34th edition, 2023), while CP, Ca and TP were measured values based on GB/T 6432—2018, GB/T 6436—2018 and GB/T 6437—2018, respectively. |
表3 维生素和益生菌复合添加剂组成Table 3 Composition of vitamin and probiotic composite additive |
| 项目Items | 含量Content |
|---|---|
| 维生素A Vitamin A | ≥500 000 IU/kg |
| 维生素D3 Vitamin D3 | ≥80 000 IU/kg |
| 维生素E Vitamin E | ≥1 000 mg/kg |
| 功能菌总数 Total number of functional bacteria | ≥2.4×108 CFU/g |
| 枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis | ≥1.0×107 CFU/g |
| 嗜酸乳杆菌 Lactobacillus acidophilus | ≥2.3×108 CFU/g |
| 水分Moisture | ≤10% |
1.2 睾丸组织样品采集
1.3 精液采集与精液品质测定
1.4 转录组测序
1.5 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证转录组测序结果
表4 引物序列Table 4 Primer sequences |
| 基因名称 Gene names | 引物序列 Primer sequence (5'—3') | ||
|---|---|---|---|
| 单酰甘油磷酸酰 基转移酶3 AGPAT3 | F:ACACTAGTCCTCTGGCCCAT R:CTGTAGCCTCGTCGGAGAAC | ||
| Nei核酸内切酶 Ⅷ样蛋白3 NEIL3 | F:GGAAAACTTGGATGTCTGCTCC R:GGAGACCCAGTTTTACGGCA | ||
| IKAROS家族锌 指蛋白3 IKZF3 | F:AGAGGAAAAGCTCCATGCCC R:GAGATGGCGTTGTTGATGGC | ||
| 细胞因子信号 转导抑制因子2 SOCS2 | F:GTACCAGGACGGCAAGTTCA R:TAGAGGTGGACCGTCCCATT | ||
| 脑特异性血管 生成抑制剂3 ADGRB3 | F:GCCAGGATCCAATCAATGCG R:ACGCAATGTCCACGTCCTTT | ||
| 肌营养不良蛋白 相关蛋白2 DRP2 | F:GCCTGTCCCCTGATGATAGC R:CCAGTTCCCCCTTGTCATCC | ||
| 甘油醛-3-磷 酸脱氢酶 GAPDH | F:GAACATCATCCCAGCGTCCA R:CGGCAGGTCAGGTCAACAAC |
1.6 数据分析
2 结果与分析
2.1 饲粮中添加维生素和益生菌复合添加剂对生理重塑公鸡体重、睾丸重、精子密度和精子活力的影响
2.2 睾丸转录组测序数据质控
表5 转录组测序质控结果Table 5 Transcriptome sequencing quality control results |
| 项目 Items | 样品编号 Sample No. | 原始读长 Raw reads | 净读长 Clean reads | 质量值≥20的碱基百分比 Percentage of bases with quality score≥20 (Q20)/% | 质量值≥30的碱基百分比 Percentage of bases with quality score≥30 (Q30)/% |
|---|---|---|---|---|---|
D组 D group | D-1 | 41 542 392 | 39 261 158 | 97.73 | 93.76 |
| D-2 | 42 556 110 | 40 298 350 | 97.67 | 93.51 | |
| D-3 | 42 798 076 | 40 485 520 | 97.50 | 93.15 | |
H组 H group | H-1 | 42 956 904 | 40 660 098 | 97.66 | 93.48 |
| H-2 | 44 354 150 | 41 937 918 | 97.32 | 92.73 | |
| H-3 | 42 644 098 | 40 309 142 | 97.26 | 92.55 |
2.3 差异基因表达分析
表6 部分差异基因表达状态及功能Table 6 Expression status and function of some differential genes |
| 基因名称 Gene names | 表达状态 Expression state | 基因功能 Gene function | |||
|---|---|---|---|---|---|
| 肌动蛋白凝胶蛋白 TAGLN | 下调 | 是一种肌动蛋白相关蛋白,可影响肌动蛋白丝的动力学, 通常被认为是肿瘤抑制因子[7] | |||
| 类固醇激素合成急性调节蛋白 STAR | 下调 | 在小鼠精子发生中发挥重要作用,表达或活性受到影响 可引起睾丸组织内睾酮含量改变[8] | |||
| 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸氧化酶4 NOX4 | 下调 | 是一种组成型活性烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH) 氧化酶,可持续产生低水平的过氧化氢(H2O2);通过染色 质重塑促进内皮分化[9] | |||
| Fms样酪氨酸激酶3 FLT3 | 下调 | 与其配体结合后可调节造血干细胞的生长[10] | |||
| 胶原十二型α1链 COL12A1 | 下调 | 作为一种新型预后生物标志物,可激活 胰腺癌中的癌症相关成纤维细胞[11] | |||
| 血管生成素4 ANGPT4 | 下调 | 是一种环境依赖性TEK受体酪氨酸激酶(TIE2) 激动剂或拮抗配体,可在癌症中诱导多种反应[12] | |||
| 易洛魁人同源框4 IRX4 | 下调 | 可识别有助于心室心肌发育的心室特异性细胞群[13] | |||
| 单酰甘油磷酸酰基转移酶3 AGPAT3 | 上调 | 对增殖和减数分裂的启动有影响[14] | |||
| 16号染色体开放阅读框89 C16orf89 | 上调 | 在对犬的研究中,它存在于富含精子部分的蛋白质中[15] | |||
| 晚疫病抗性基因 BLB1 | 下调 | 是主要组织相容性复合体Ⅱ类分子(MHC-Ⅱ)和 分子抗原递呈通路相关的基因[16] | |||
| Cas支架蛋白家族成员4 CASS4 | 下调 | 在黏着斑介导的整合素依赖性信号通路中的中间体,并与黏附 斑激酶(FAK)和非受体酪氨酸激酶(SRC)家族激酶结合 以激活调节肌动蛋白细胞骨架的下游效应子[17] | |||
| 非典型趋化因子受体4 ACKR4 | 下调 | 通过调节趋化因子21(CCL21)的瘤内丰度来抑制肿瘤中 CD103阳性(CD103+)树突状细胞的保留[18] | |||
| 白细胞介素-13受体A1 IL-13RA1 | 下调 | 为小鼠、大鼠和人脑中的神经元、突触蛋白,参与上调N-甲基-D- 天冬氨酸受体(NMDAR)和α-氨基-3-羟基-5-甲基-4-异唑丙酸 受体(AMPAR)亚基的磷酸化,进而增加突触活性和环磷酸腺苷反应 元件结合蛋白(CREB)介导的转录[19] | |||
| 发散性蛋白激酶结构域1 FAM69C | 下调 | 通过磷酸化真核翻译起始因子2α(eIF2α) 来促进应激颗粒组装[20] | |||
| Notch调节锚蛋白 NRARP | 下调 | 是Notch通路组分中的效应子,在睾丸中转录并在生殖细胞、 支持细胞和间质细胞中表达[21] | |||
| DNA结合抑制因子4 ID4 | 下调 | 标记小鼠睾丸中的精原干细胞[22] | |||
| 二重特异性去磷酸化酶26 DUSP26 | 下调 | 神经元中缺失会增加线粒体活性氧(ROS)水平并同时激活 丝裂原活化蛋白激酶/p38(MAPK/p38)信号通路和炎症反应[23] | |||
| 肌营养不良相关糖蛋白 DRP2 | 下调 | 一种新型人类抗肌萎缩蛋白同源物[24] | |||
| Nei核酸内切酶Ⅷ样蛋白3 NEIL3 | 下调 | 通过靶向修复S/G2期端粒的氧化损伤来保护基因组稳定性[25] | |||
| ⅩⅥ型胶原蛋白alpha1链 COL16A1 | 下调 | 为心肌梗死后的心肌重塑中的差异基因[26] | |||
| T细胞急性淋巴细胞白血病1 TAL1 | 下调 | 在成熟大鼠睾丸中表达上调,可能参与细胞分裂[27] | |||
| 同源盒B6 HOXB6 | 下调 | 在未成熟和成熟睾丸细胞的附睾和输精管层 产生不同强度的免疫定位[28] | |||
| 纤溶酶原 PLG | 下调 | 卵母细胞使用纤溶酶原-纤溶酶系统(PLG-PLA) 去除多余的精子[29] | |||
| 钾电压门控通道亚家族H成员6 KCNH6 | 下调 | 保护胰岛免受内质网应激和细胞凋亡[30] |

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