1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 主要试剂配制
1.2.1 LPS工作液的配制
1.2.2 AOS工作液的配制
1.2.3 细胞冻存液的配制
1.3 细胞复苏与培养
1.4 预试验参数优化
1.5 试验设计
1.6 测定指标与方法
1.6.1 qRT-PCR
表1 cDNA反应体系Table 1 cDNA reaction system |
| 项目 Items | 用量 Volume |
|---|---|
| SuperRT三代一体化逆转录预混液 SuperRT Ⅲ all-in-one RT mix | 1 μL |
| RNA模板 RNA template | ≤1 μg总RNA |
| 无逆转录酶对照混合液 No RT control mix | 4 μL |
| 无核酸酶水 Nuclease-free water | 补足至20 μL |
表2 cDNA反应程序Table 2 cDNA reaction procedure |
| 步骤 Steps | 温度 Temperature/℃ | 时间 Time/min |
|---|---|---|
| 1 | 37 | 2 |
| 2 | 50 | 15 |
| 3 | 85 | 2 |
表3 PCR反应体系Table 3 PCR reaction system |
| 项目 Items | 用量 Volume/μL |
|---|---|
| 2×通用型SYBR荧光定量预混液 2×universal SYBR qPCR mix | 10 |
| 上游引物 Primer F (10 μmol/L) | 0.5 |
| 下游引物 Primer R (10 μmol/L) | 0.5 |
| cDNA | 1 |
| 参比染料 ROX reference dye | 0.4 |
| 无核糖核酸酶双蒸水 RNase-free ddH2O | 补至20 |
表4 PCR反应程序Table 4 PCR reaction procedure |
| 反应步骤 Reaction steps | 温度 Temperature/℃ | 持续时间 Duration | 循环次数 No. of cycles/次 |
|---|---|---|---|
| 预变性 Initial denaturation | 95 | 2 min | 1 |
| 扩增循环 Amplification | |||
| 变性 Denaturation | 95 | 15 s | 40 |
| 退火延伸数据采集 Annealing extension data collection | 60 | 30 s | 40 |
| 熔解曲线分析 Melting curve analysis | 根据仪器推荐程序设置 |
表5 引物序列Table 5 Primer sequences |
| 基因 Genes | 引物序列 Primer sequences (5'—3') | 登录号 Accession number | 产物大小 Product size/bp |
|---|---|---|---|
| 甘油醛-3-磷酸脱氢酶 GAPDH | F:GATAGGCCCACCCAAAAGGG R:GGATGCGGCTGCGCTT | XM_060411595.1 | 142 |
| 闭锁小带蛋白-1 ZO-1 | F:GGACAAAGAGAAGGGTGAGACC R:GCTCCACTGGCTTCAGGAAC | XM_060401409.1 | 83 |
| 封闭蛋白-1 Claudin-1 | F:CCCGGTCAATGCCAGGTATG R:TTGTTTTCCGGGGACAGGAG | NM_001185016.1 | 113 |
| 闭合蛋白 Occludin | F:GAAGATCAAGTGAGCACCGA R:TACAATGGCAATGGCAATTCATC | XM_060400238.1 | 93 |
| B淋巴细胞瘤-2相关X蛋白 BAX | F:AAACTGGTGCTCAAGGCCC R:TCTTCAGCGACTCAGCCAAG | XM_027978594.3 | 148 |
| B细胞淋巴瘤-2 Bcl-2 | F:GGGGTCATGTGTGTGGAGAG R:ACAAAGGCATCCCAGCCTC | XM_012103831.5 | 134 |
| 封闭蛋白-4 Claudin-4 | F:CCGTCCCCCTTCTTCAATCC R:TTCTCATGGCCCCAGGTTTC | NM_001185017.2 | 107 |
| B细胞淋巴瘤-2相关死亡促进因子 BAD | F:TTTCGGAAGACTGAGGTCTGAT R:CGGCGAAGTTAGGGTTAATCTC | XM_004019650.3 | 185 |
| 半胱天冬蛋白酶-3 Caspase-3 | F:CACGGAAGCAAATCAGTGGAC R:CGACAGGCCATGCCAGTATT | XM_060406953.1 | 128 |
| 半胱天冬蛋白酶-8 Caspase-8 | F:CCAGGATTCGCCTCTGGTAA R:CCAGGATTCGCCTCTGGTAA | XM_012142477.5 | 130 |
| 半胱天冬蛋白酶-9 Caspase-9 | F:TGACCTGACTGCCAAGCAAA R:CAGCCGTGAGAGAGGATGAC | XM_060396596.1 | 102 |
| 肿瘤蛋白p53 p53 | F:CAGGGCTCATTCTAGCCACCTG R:AGGGTGGGGATGTCAACCA | NM_001009403.1 | 136 |
1.6.2 蛋白质印迹(Western blot)
表6 抗体信息Table 6 Antibody information |
| 抗体名称 Names of antibodies | 稀释比例 Dilution ratio | 生产商 Manufacturers | 货号 Catalog number |
|---|---|---|---|
| β-肌动蛋白 β-actin | 1∶2 000 | 优抗 | UM4001 |
| Toll样受体4 TLR4 | 1∶1 000 | Proteintech | 19811-1-AP |
| 髓样分化因子88 MyD88 | 1∶1 000 | CST | #4283 |
| 细胞外信号调节激酶 ERK | 1∶1 000 | CST | #4695 |
| c-Jun氨基末端激酶 JNK | 1∶1 000 | CST | #9252 |
| p38丝裂原活化蛋白激酶p38 | 1∶1 000 | CST | #8690 |
| 磷酸化细胞外信号调节激酶 P-ERK | 1∶1 000 | CST | #4370 |
| 磷酸化c-Jun氨基末端激酶 P-JNK | 1∶1 000 | CST | #9255 |
| 磷酸化p38丝裂原活化蛋白激酶P-p38 | 1∶1 000 | CST | #4511 |
| 二抗 Secondary antibody | |||
| 羊抗兔免疫球蛋白G-辣根过氧化物酶偶联物 Goat anti-rabbit IgG-HRP | 1∶4 000 | Affinity | S0001 |
| 羊抗小鼠免疫球蛋白G-辣根过氧化物酶偶联物 Goat anti-mouse IgG-HRP | 1∶4 000 | Affinity | S0002 |
1.7 数据统计与分析
2 结果与分析
2.1 LPS对瘤胃上皮细胞紧密连接蛋白及凋亡相关基因表达的影响
图1 不同LPS浓度对瘤胃上皮细胞紧密连接蛋白及凋亡相关基因表达的影响数据柱无字母或相同字母表示差异不显著(P>0.05),不同小写字母表示差异显著(P<0.05)。下图同。 Fig.1 Effects of different LPS concentrations on expression of tight junction protein and apoptotic related genes in rumen epithelial cells Value columns with no letter or the same letter mean no significant difference (P>0.05), while with different small letters mean significant difference (P<0.05). The same as below. |

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