1 材料与方法
1.1 试验饲粮与试验设计
表1 柠条饲料组成(干物质基础)Table 1 Caragana feed composition (DM basis)% |
| 项目 Items | 含量 Content |
|---|---|
| 浓缩料 Concentrate | 15 |
| 玉米 Corn | 30 |
| 麸皮 Bran | 10 |
| 柠条 Caragana | 20 |
| 苏丹草 Sudan grass | 25 |
| 合计 Total | 100 |
浓缩料营养水平The nutrient levels of concentrate:粗蛋白质CP≥32.0%,粗脂肪 CF≥19.0%,粗灰分ash≥19.0%, Ca 1.5%~4.5%, P≥0.5%, NaCl 2.0%~4.5%,赖氨酸Lys≥1.0%,水分moisture≥12.0%。 |
表2 饲喂方案及试验饲粮营养水平(干物质基础)Table 2 Feeding scheme and nutrition levels of trial diets (DM basis)% |
| 项目 Items | 对照组 Control group | 试验1组 Trial group 1 | 试验2组 Trial group 2 | 试验3组 Trial group 3 |
|---|---|---|---|---|
| 饲喂方案 Feeding scheme | ||||
| 柠条饲料 Caragana feed | 100 | 75 | 50 | 25 |
| 柠条发酵饲料 Caragana fermented feed | 25 | 50 | 75 | |
| 合计Total | 100 | 100 | 100 | 100 |
| 营养水平 Nutrient levels | ||||
| 粗蛋白质 CP | 13.08 | 13.75 | 14.43 | 15.10 |
| 中性洗涤纤维 NDF | 59.35 | 55.62 | 51.88 | 48.15 |
| 酸性洗涤纤维 ADF | 24.60 | 24.90 | 25.21 | 25.51 |
| 钙 Ca | 1.22 | 1.09 | 0.95 | 0.82 |
| 磷 P | 0.56 | 0.52 | 0.48 | 0.44 |
营养水平为实测值。 | |
Nutrient levels were measured values. |
1.2 柠条饲料的发酵
1.3 饲养管理
1.4 样品采集与处理
1.5 样品测序
1.5.1 样品DNA提取与PCR扩增
1.5.2 测序
1.6 数据处理与分析
2 结果与分析
2.1 柠条发酵饲料对滩羊生长性能的影响
表3 柠条发酵饲料对滩羊生长性能的影响Table 3 Effects of caragana fermented feed on growth performance of Tan sheep |
| 项目 Items | 对照组 Control group | 试验1组 Trial group 1 | 试验2组 Trial group 2 | 试验3组 Trial group 3 | P值 P-value |
|---|---|---|---|---|---|
| 初始体重 Initial body weight/kg | 24.38±0.51 | 24.54±0.60 | 24.49±0.44 | 24.26±0.59 | 0.076 6 |
| 终末体重 Final body weight/kg | 35.44±0.55b | 36.73±0.55ab | 37.09±1.03a | 35.69±1.08ab | 0.031 1 |
| 平均日增重 ADG/g | 112.12±3.48b | 117.21±4.11ab | 121.15±2.98a | 109.90±1.69ab | 0.032 3 |
同行数据肩标不同小写字母表示差异显著(P<0.05),不同大写字母表示差异极显著(P<0.01),无字母或相同字母表示差异不显著(P>0.05)。下表同。 | |
In the same row,values with different small letter superscripts mean significant difference (P<0.05), with different capital letter superscripts mean significant difference (P<0.01), while with no letter or the same letter superscripts mean no significant difference (P>0.05). The same as below. |
2.2 柠条发酵饲料对滩羊瘤胃菌群多样性的影响
2.2.1 操作分类单元(OTU)数量
2.2.2 Alpha多样性稀释分析
表4 Alpha多样性Table 4 Alpha diversity |
| 项目 Items | 对照组 Control group | 试验1组 Trial group 1 | 试验2组 Trial group 2 | 试验3组 Trial group 3 | P值 P-value |
|---|---|---|---|---|---|
| Ace指数 Ace index | 156.57±56.26 | 90.39±73.97 | 157.63±17.83 | 142.84±50.31 | 0.422 |
| Chao1指数 Chao1 index | 138.86±56.27 | 86.90±65.65 | 152.03±17.42 | 151.58±55.13 | 0.419 |
| Simpson指数 Simpson index | 0.89±0.05 | 0.73±0.08 | 0.68±0.17 | 0.83±0.10 | 0.172 |
| Shannon指数 Shannon index | 4.63±1.00 | 2.96±0.35 | 3.13±1.04 | 4.12±1.48 | 0.235 |
| 覆盖率 Coverage | 99 | 99 | 99 | 99 | 0.423 |
2.2.3 Beta多样性分析
2.3 瘤胃菌群组成和结构分析
2.3.1 门(phylum)水平菌群组成和结构分析
图4 门水平上瘤胃菌群分布Firmicutes:厚壁菌门;Bacteroidota:拟杆菌门;Proteobacteria:变形菌门;Tenericutes:软壁菌门;Planctomycetes:浮霉菌门;Verrucomicrobia:疣微菌门;Actinobacteria:放线菌门;Euryarchaeota:广古菌门;Others:其他。 Fig.4 Distribution of rumen flora at phylum level |
表5 柠条发酵饲料对滩羊瘤胃菌群在门平上相对丰度的影响Table 5 Effects of caragana fermented feed on relative abundance of rumen flora at phylum level of Tan sheep% |
| 项目 Items | 对照组 Control group | 试验1组 Trial group 1 | 试验2组 Trial group 2 | 试验3组 Trial group 3 | P值 P-value |
|---|---|---|---|---|---|
| 厚壁菌门 Firmicutes | 58.90±4.09b | 46.07±6.23c | 73.78±12.21a | 46.97±7.02c | 0.043 |
| 拟杆菌门 Bacteroidota | 31.11±4.11 | 38.34±4.69 | 21.28±3.01 | 35.54±4.21 | 0.476 |
| Kiritimatiellaeota | 3.03±0.71 | 0.61±0.03 | 1.09±0.59 | 2.20±0.88 | 0.321 |
| Patescibacteria | 2.35±0.45a | 0.16±0.01b | 0.56±0.06b | 0.90±0.05b | 0.033 |
| 软壁菌门 Tenericutes | 1.68±0.06 | 0.49±0.05 | 1.03±0.22 | 1.80±0.97 | 0.317 |
| 浮霉菌门 Planctomycetes | 1.15±0.04 | 0.01±0.00 | 1.08±0.52 | 0.13±0.00 | 0.231 |
| 变形菌门 Proteobacteria | 0.83±0.12b | 14.27±2.13a | 0.67±0.20b | 11.62±2.56a | 0.041 |
| 疣微菌门 Verrucomicrobia | 0.44±0.05 | 0.02±0.00 | 0.00±0.00 | 0.70±0.03 | 0.330 |
| 广古菌门 Euryarchaeota | 0.17±0.00 | 0.00±0.00 | 0.02±0.00 | 0.03±0.00 | 0.421 |
| 放线菌门 Actinobacteria | 0.15±0.01 | 0.02±0.00 | 0.48±0.05 | 0.00±0.00 | 0.356 |
| Uncultured_bacterium_k_Bacteria | 0.07±0.00 | 0.00±0.00 | 0.00±0.00 | 0.00±0.00 | 0.548 |
| 蓝细菌门 Cyanobacteria | 0.07±0.00 | 0.00±0.00 | 0.00±0.00 | 0.00±0.00 | 0.324 |
| 互养菌门 Synergistetes | 0.04±0.00 | 0.00±0.00 | 0.00±0.00 | 0.00±0.00 | 0.452 |
| 螺旋菌门 Spirochaetes | 0.00±0.00 | 0.00±0.00 | 0.00±0.00 | 0.12±0.00 | 0.365 |
2.3.2 属(genus)水平菌群组成和结构分析
图5 属水平上瘤胃菌群分布Succiniclasticum:解琥珀酸菌属;Prevotella_1:普雷沃菌属_1;Prevotella:普雷沃菌属; Ruminococcus:瘤胃球菌属;Selenomonas:牛月形单胞菌;Succinivibrio:琥珀酸弧菌属;Prevotellaceae_UCG-001:普雷沃菌科_UCG-001;Megasphaera:巨球形菌属;Rikenellaceae_RC9_gut_group:理研菌科RC9肠道群;Others:其他。 Fig.5 Distribution of rumen flora at genus level |
表6 柠条发酵饲料对滩羊瘤胃菌群在属水平上相对丰度的影响Table 6 Effects of caragana fermented feed on relative abundance of rumen flora at genus level of Tan sheep% |
| 项目 Items | 对照组 Control group | 试验1组 Trial group 1 | 试验2组 Trial group 2 | 试验3组 Trial group 3 | P值 P-value |
|---|---|---|---|---|---|
| 其他 Others | 33.14±3.23a | 11.63±1.20b | 15.03±4.01b | 34.51±3.56a | 0.032 |
| 解琥珀酸菌属 Succiniclasticum | 19.31±3.78b | 24.52±4.98b | 56.79±6.81a | 30.43±4.02ab | 0.043 |
| 瘤胃球菌属 Ruminococcus | 13.96±2.12a | 0.32±0.02b | 2.03±0.96ab | 0.93±0.03b | 0.033 |
| 普雷沃菌属_1 Prevotella_1 | 12.66±3.02b | 15.19±4.56b | 25.98±6.88a | 11.69±3.33b | 0.041 |
| Uncultured_bacterium_f_Muribaculaceae | 7.37±1.22ab | 0.47±0.05c | 2.80±0.99bc | 12.40±4.22a | 0.044 |
| 普雷沃菌科UCG-001 Prevotellaceae_UCG-001 | 7.23±1.97a | 0.99±0.12b | 2.87±0.98ab | 0.94±0.22b | 0.039 |
| 牛月形单胞菌 Selenomonas | 3.21±0.97 | 2.86±0.52 | 4.75±1.03 | 2.13±0.85 | 0.323 |
| 理研菌科RC9肠道群 Rikenellaceae_RC9_gut_group | 2.72±0.95ab | 0.14±0.02b | 0.37±0.01b | 6.96±1.21a | 0.044 |
| 巨球形菌属 Megasphaera | 0.24±0.02b | 10.63±2.99a | 0.01±0.00b | 0.01±0.00b | 0.045 |
| 琥珀酸弧菌属 Succinivibrio | 0.16±0.02b | 12.11±3.20a | 0.17±0.01b | 0.00±0.00b | 0.035 |
