1 材料与方法
1.1 启动子载体构建及活性检测
1.1.1 启动子载体构建
表1 引物信息Table 1 Primer information |
| 基因 Genes | 引物序列 Primer sequence (5'—3') | 产物大小 Product size/bp |
|---|---|---|
| 尿素转运因子-B-1 UT-B-1 | F:CCGCTCGAGATTCCTTTCACTCCTATGCCAG- R:GGGAAGCTTCTAAACCTGTGATGAGAAACAGA | 2 173 |
| 尿素转运因子-B-2 UT-B-2 | F:CCGCTCGAGTTCTGCCCATTAGTTGCTTTTC R:GGGAAGCTTCTAAACCTGTGATGAGAAACAGA | 1 546 |
| 尿素转运因子-B-3 UT-B-3 | F:CCGCTCGAGTTTACCCAAATCACAGGCTTCT R:GGGAAGCTTCTAAACCTGTGATGAGAAACAGA | 478 |
下划线表示酶切位点。 | |
The underline represents the enzyme cleavage site. |
1.1.2 启动子载体活性检测
1.2 瘤胃上皮细胞原代培养
1.3 不同浓度尿素对奶牛瘤胃上皮细胞氮转运相关基因及蛋白表达的影响
1.3.1 细胞培养试验
表2 细胞培养试验设计Table 2 Experiment design of cell culture mmol/L |
| 项目 Item | 组别Groups | |||
|---|---|---|---|---|
| 对照CK | Ⅰ | Ⅱ | Ⅲ | |
| 添加量Addition | 0 | 0.5 | 1.0 | 1.5 |
1.3.2 qRT-PCR检测
表3 引物序列Table 3 Primer sequences |
| 基因 Genes | 登录号 Accession No. | 引物序列 Primer sequences (5’—3’) | 产物大小 Product size/bp |
|---|---|---|---|
| 甘油醛-3-磷酸脱氢酶 GAPDH | AB098934 | F:GTCGGAGTGAACGGATTTGG R:CAATGTCCACTTTGCCAGAGTTAA | 76 |
| 尿素转运因子-B UT-B | NM_001008666 | F:TATGTCCATGACGTGTCCAGTCT R:GCAGGTCCCATTTGCTCAAC | 65 |
| 水通道蛋白3 AQP3 | NM_001079794 | F:CGCGAGCCCTGGATCA R:CCCAGATCGCATCGTAATACAA | 103 |
| GATA结合蛋白2 GATA2 | NM_001192114 | F:GCCCTTGCTGTGGAACAAAG R:AGTTACTTCCGGCTGTGGTG | 310 |
1.3.3 Western blot试验
1.4 GATA2对UT-B启动子的作用
表4 共转染试验设计Table 4 Experimental design of cotransfection |
| 项目 Item | 组别Groups | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Ⅰ | Ⅱ | Ⅲ | Ⅳ | Ⅴ | Ⅵ | |
| 质粒 Plasmid | UTB-1+PCDNA 3.1-GATA2 | UTB-1+PCDNA 3.1-NC | UTB-2+PCDNA 3.1-GATA2 | UTB-2+PCDNA 3.1-NC | UTB-3+PCDNA 3.1-GATA2 | UTB-3+PCDNA 3.1-NC |
1.5 数据统计分析
2 结果
2.1 奶牛瘤胃上皮细胞UT-B核心启动子区域的确定
图1 牛UT-B基因转录起始位点前2 kb正义链序列Fig.1 Sense strand sequence of 2 kb before transcription start site of UT-B gene of cattle |
图2 牛UT-B 5’侧翼2 kb区潜在转录因子结合位点预测HSF:热休克转录因子 heat shock factor;GATA-2:GATA2结合蛋白2 GATA binding protein 2;SRY:性别决定基因 sex determination region of Y chromosome;Cap:加帽蛋白 capping protein;CdxA:尾侧型同源盒基因A caudal type homeobox A;Oct-1:有机阳离子转运蛋白1 organic cation transporter 1;NIT2g:腈水解酶2 nitrilase family member 2;Nkx-2:NK型同源盒2 NK2 homeobox;Skn-1:protein skinhead-1。 Fig.2 Potential transcription factor binding site in 2 kb region of UT-B 5’-flanking region |
2.2 奶牛瘤胃上皮细胞原代培养结果
2.3 尿素对奶牛瘤胃上皮细胞UT-B、GATA2及AQP3基因表达量的影响
2.4 尿素对奶牛瘤胃上皮细胞UT-B、GATA2及AQP3蛋白表达量的影响
2.5 GATA2转录因子对UT-B启动子的作用
2.5.1 GATA2载体测序
2.5.2 GATA2对UT-B启动子的作用
表5 GATA2真核表达载体对不同缺失片段UT-B启动子载体的影响Table 5 Effects of GATA2 eukaryotic expression vector on UT-B promoter vector of different deletion fragments |
| 项目 Items | 有GATA2 With GATA2 | 无GATA2 Without GATA2 | P值 P-value | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 萤火虫荧 光素酶 FLuc | 海肾荧 光素酶 Rluc | 萤火虫荧光素 酶/海肾荧光 素酶比值 F/R Ratio | 萤火虫荧 光素酶 FLuc | 海肾荧 光素酶 Rluc | 萤火虫荧光素 酶/海肾荧光 素酶比值 F/R Ratio | |||
| 尿素转运因子-B-1 UT-B-1 | 13 827 | 39 118 | 0.35 | 11 310 | 33 921 | 0.33 | 0.020 | |
| 尿素转运因子-B-2 UT-B-2 | 12 603 | 41 482 | 0.30 | 11 369 | 44 836 | 0.25 | 0.038 | |
| 尿素转运因子-B-3 UT-B-3 | 13 637 | 48 121 | 0.28 | 10 976 | 40 830 | 0.27 | 0.423 | |
